أجبرت الزراعة الحديثة على تلبية الاحتياجات المتزايدة للسكان، وركزت على الاستخدام المكثف للأرض، وبذلك أضحت مسؤولة، إلى حد كبير، عن تلوث المياه العميقة، بفعل تأثير الاستعمال المكثف للأسمدة والمبيدات.كما تعاني العديد من البلدان، في العقود الأخيرة، زيادة تركيزات النيترات في مياهها الجوفية، ما يتنافى مع المعيار المحدد من قبل منظمة الصحة العالمية. وتتميز منطقة سوس ماسة بتنوع نظم محصولها، وكثافة مزروعاتها، ما يبرز إشكالية تأثير الاستعمال المكثف للأسمدة والمبيدات، خصوصا في زراعات الخضراوات المكثفة تحت البيوت المغطاة، وأصبح مزارعو المنطقة يسعون لترشيد الاستعمال المعقلن للمبيدات. وقال الباحث عبد العزيز ميموني، في سياق دراسة في الموضوع، إن الاستعمال المكثف للأسمدة الآزوتية يترك فائضا سنويا ما بين 600 وألف كلغ من الآزوت، ذلك أن جزءا كبيرا من مادة النترات يتسرب إلى الفرشة الباطنية، ويلوث المياه الجوفية. كما أوضحت دراسات أنجزها البحث الزراعي والجامعة، خاصة خرائط تلوث المياه الجوفية لحوض سوس ماسة، أن كمية النترات تتزايد بوتيرة مستمرة رغم أنها قليلة، تبقى سلبية، خصوصا في زراعة الطماطم والفاصوليا، ذلك أن المزارعين يستعملون أسمدة حوالي 600 و750 كلغ من الآزوت في الهكتار للحصول على 220 طنا من الطماطم في الهكتار. وتبين الدراسة والأبحاث أن كمية الآزوت يمكن تقليصها إلى 550 كلغ آزوت في الهكتار، لإنتاج هذه الكمية. وساق الباحث ميموني، خلال عرض قدمه بمكتبة الإسكندرية، في إطار مؤتمر عالمي نظمته جامعة سانغور حول "الماء والنفايات والتنمية المستدامة"، نموذج زراعة الفاصوليا، التي يستعمل زارعوها حوالي 180كلغ من الآزوت في الهكتار، في حين تحث الأبحاث على الاكتفاء ب 120 كيلوغراما في الهكتار، أي أن هناك فائضا في استعمال سماد الآزوت، إذ أن هذه المزروعات المكثفة دخلت إلى منطقة سوس منذ حوالي 40 سنة، ولاستدامتها، وجب استعمال معقلن للأسمدة، خصوصا الآزوتية، للحفاظ على المياه الجوفية والبيئة عامة. من ناحية استعمال المبيدات، تشهد منطقة سوس ماسة تكثيف الخضراوات تحت البيوت المغطاة، خصوصا الطماطم. ودعا ميموني إلى مطالبة الفلاحين باعتماد نظم زراعية معقلنة، تعتمد على دورات زراعية للحفاظ على التوازن البيولوجي للأرض، وتجنب مختلف الأمراض، التي تطال التربة، خاصة تفشي "النيماطود"، وبعض الفطريات التي، إن لم تحارب، تتلف المحصول. ولهذا اضطر المزارعون لمعالجة التربة سنويا بمواد مضادة لهذه الأمراض، مثل "البروم"، و"الكلور"، ومواد سامة أخرى. وأدت هذه المعالجة إلى تحسين الإنتاج، لكن لها تأثيرات جانبية خطيرة على المدى المتوسط والبعيد على خصوبة الأرض البيولوجية، إذ أظهرت أبحاث في هذا المجال أن هذه المبيدات تقتل جميع المكونات الحية داخل الأرض، مثل الديدان الخيطية النافعة، التي لها أدوار مهمة في دورات الآزوت، والفوسفور، ومواد أخرى، وانخفاض المواد العضوية في التربة، وتعدد مسببات الأمراض. كما تبين الدراسة، حسب الباحث ميموني، أن هذه المبيدات تترك في الأرض مخلفات من مواد "البروم"، و"الكلور"، تفوق حوالي 10مرات المعدل العادي، ما يؤدي إلى عقم التربة، وضعف المردودية. ودعا الباحث إلى تغيير سلوكات المزارعين، باستعمال طرق مندمجة لمواجهة هذه الإشكالية، من خلال إيجاد طرق ناجعة واقتصادية لدورات زراعية متنوعة الزراعات ومتواترة، لصد تكاثر الأمراض الأرضية، والحفاظ على التوازن البيئي، وكذا نهج طرق محاربة ميكانيكية حرارية (بتشميس التربة)، وبيولوجية كاستعمال نبات بلعمان، والفجل الكلئي، والحرمل، ونباتات أخرى، إضافة إلى التحكم في وسائل الإنتاج على مستوى الري والسقي والتسميد.