قبل شهرين انطلق ببوجدور مشروع مهيكل يتمثل في فصل التطهير السائل الخاص بالمدينة عن التطهير الخاص بالمنطقة الصناعية القديمة ليعزز البنية التحتية للمدينة في هذا المجال حيث أن كل الأحياء تستفيد من هذه الخدمة بنسبة 100% منذ ست سنوات مضت. هذا المشروع الذي وصلت الأشغال فيه نسبة 60% تم الشروع فيه بعد مراسلة السيد عامل اقليم بوجدور للمصالح الجهوية للقطاع الوصي بالعيون بعد تشخيص ميداني من أجل التصدي لمشكل خنق وانفجار بعض القنوات الناتج عن غياب شبكة لتصريف مياه الامطار خاصة بمحاذاة محطة الضخ رغم المجهودات المبذولة في هذا المجال ،والتي يتم التعامل معها في الوقت المناسب وفق مخطط مدروس للمخاطر المحتملة، لكن المشكل يبقى حاضرا من حين لآخر رغم كل التدخلات المباشرة التي تتم من طرف مصالح المكتب الوطني للماء وقسم التجهيز بالعمالة بإشراف مباشر من عامل الاقليم. وقد صرح السيد منصور شماد رئيس قسم التجهيز بعمالة بوجدور لبوابة الصحراء أن المشروع المقام حاليا سيتم الانتهاء منه في غضون الشهرين القادمين لينهي إكراها كان مطروحا منذ مدة وهو انفجار القنوات للضغط الحاصل عليها من مياه الامطار ، بينما المنطقة الصناعية الحديثة وهي الوحيدة في الصحراء من الجيل الثالث فهي تتوفر على شبكة التطهير السائل الخاص بها بمواصفات متميزة وكذا محطة للمعالجة Station de prétraitement. جدير بالذكر أن مدينة بوجدور تتوفر ومنذ يونيو 2012 على شبكة للتطهير السائل يصل طولها إلى 141 كلم باستثمار إجمالي قدره 122.5 مليون درهم موزعة على قنوات الصرف و محطتين ضخمتين لمعالجة المياه العادمة:الاولى هي : محطة الضخ التي تطلب إحداثها استثمارا قدره 6 مليون درهم، و محطة معالجة المياه العادمة بالزرب السطحي التي تقع جنوب مدينة بوجدور ب 5كلم التي تتمكن من معالجة 6500 متر مكعب في اليوم وتطلب انشاءها استثمارا بقيمة 30مليون درهم وهي الوحيدة على صعيد الاقاليم الجنوبية والتي يشرف عليها المكتب الوطني للماء والكهرباء قطاع الماء ببوجدور.