عززت قوات الدفاع المدني السودانية من تواجدها على طول مجرى نهر النيل بالعاصمة الخرطوم، وذلك بعد حدود ارتفاع في منسوب المياه يهدد بغمر الأحياء الواقعة على ضفتي النهر ونشرت قوات الدفاع المدني وحدات إضافية على طول مجرى نهر النيل خصوصا على الجسور التي تربط مدن العاصمة الثلاث. وحذرت جمعية الهلال الأحمر السوداني من زيادة في منسوب النيل الأزرق (الرافد الرئيس لنهر النيل) في ولاية سنار المتاخمة للهضبة الإثيوبية على حدود البلاد الشرقية الجنوبية. وتوقعت الجمعية امتداد الزيادة إلى الخرطوم والولاية الشمالية على الحدود مع مصر التي يشقها نهر النيل ليصب في البحر المتوسط. ونقلت وكالة الأنباء الرسمية، يوم الأحد 14 غشت 2016 ، عن معتمد محلية (بلدية) "شرق سنار"، عبد الرحمن عبد القادر، قوله إن "أكثر من 20 قرية تأثرت بفيضان النيل الأزرق بجانب تضرر 180 منزلا في ثلاث قرى أخرى ضربتها سيول خلفتها الأمطار الغزيرة".