مشكلة الإسلام والغرب بما أن قضية العلاقات المتوترة بين الإسلام والغرب أصبحت الشغل الشاغل للمثقفين العرب والغربيين بعد 11 سبتمبر فإنّ مالك شبل أولاها عناية خاصة. وقد نشر عدة كتب متتالية لتصحيح الصورة المشوّهة التي انتشرت عن الإسلام في الغرب بعد التفجيرات الأخيرة سواء في نيويورك أو واشنطن أو مدريد أو لندن أو بالي باندونيسيا أو شرم الشيخ أو الرباط والرياض الخ.. ثم جيّش كل طاقاته لشرح حقائق الإسلام للفرنسيين والأوروبيين بشكل عام وللدفاع عن إسلام العقل والتنوير الذي طغت عليه أصوات الأصوليين المزمجرة وتفجيراتهم المرعبة. ومعلوم انّه كتب مقدمة هامة لترجمة القرآن الكريم إلى الفرنسية من قبل الباحث الفرنسيّ ادوار مونتيه. وفيها طبّق المنهجية التاريخية على القرآن من أجل فهمه بشكل صحيح وتأويله بطريقة عقلانية حديثة. أمّا فيما يخصّ مشكلة الحجاب التي اندلعت في فرنسا إبان السنوات الأخيرة وأحدثت ضجة كبيرة في وقتها فهو يرى أنها مسألة ثانوية أخذت مكانة اكبر من حجمها بكثير. ولكنه في ذات الوقت يعتبر أنّ عودة الحجاب مؤخرا إلى البلدان العربية والإسلامية تمثل تراجعا بالقياس إلى عصر النهضة العربية حيث دعا قاسم أمين وهدى شعراوي وسواهما إلى نزع الحجاب.. لقد كتب مالك شبل الكثير بعد 11 سبتمبر لكي يعيد الاعتبار إلى الإسلام بعد أن أصبحت صورته مشوّهة في أذهان الأوروبيين والأمريكان. وهو يأسف لأنّهم أصبحوا يخافون الإسلام أو يكرهونه أو يحملون صورة خاطئة عنه. ولذلك فهو يحاول أن يثبت لهم من خلال أبحاثه العديدة وكتبه انّه دين وثقافة عريقة وحضارة رائعة امتدت على مدار أربعة عشر قرنا من الزمن. ويأسف مالك شبل أيضا لأنّ كلّ مسلم أصبح مشبوها في الغرب بعد هذه التفجيرات الإرهابية التي يدينها بشدة. ولذلك فإنّه صرّح قائلا لكي يضع النقاط على الحروف: إنّ أغلبية المسلمين أصبحوا رهينة وواقعين بين فكّي كمّاشة: أي بين أقلية من المتطرفين المسلمين العنيفين من جهة، وأغلبية من الغربيين الذين يشتبهون بكل ما هو عربيّ ومسلم من جهة أخرى. ويذكّرنا مالك شبل بان الإسلام كان تعدّديا في تجلّياته وانّه حيّ ومنتعش ومتسامح في جوهره. ولكنّ قوى التعصّب والانغلاق خطفته فأصبح رهينة في أيديها ولذا ينبغي تخليصه منها. وقد كان الإسلام في الماضي مبدعا في كافة المجالات. والعالم العربي الإسلامي شهد فترات كبيرة من العطاء الحضاريّ والعلاقات السلمية مع الآخرين والتفاعل الثقافيّ والتجاريّ وكلّ شيء. وبالتالي فلا ينبغي أن ننسى كلّ هذا ونركّز فقط على بن لادن والظواهري والزرقاوي وسواهم من غلاة التطرّف. لا ينبغي أن نختزل كل تاريخ العرب والإسلام إلى هذه المجموعات من المتشدّدين. هذا ظلم ومناقض للحقيقة التاريخية. ثم يقول ما معناه: باسم هذه العصور الذهبية للإسلام فانّي أشتغل وأمارس بحوثي وكتاباتي. لقد شهدت تلك العصور المجيدة ظهور عدد كبير من العلماء والأدباء والشعراء والفلاسفة والفقهاء والأطباء والخلفاء المولعين بالفنون والآداب..وأنا وريث هذا التراث كغيري من المثقفين العرب والمسلمين. ثم يدين مالك شبل تناقض الأصوليين ونزعتهم الضيقة الانغلاقية ويقول: إنهم يريدون حصر كلّ الفكر والحضارة العربية الإسلامية في القرن الأوّل الهجري/ السابع الميلادي متناسين ما قدمته العصور اللاحقة من علوم وآداب وفلسفات وتطورات ومستجدات عبر التاريخ. إنهم يجمدون الزمن في لحظة معينة ويلغون كل ما جاء بعدها. إنهم يعيشون في الماضي الغابر حيث ينغلقون على أنفسهم كليا. وبالتالي فهم يزدرون الحاضر والمستقبل بسبب سلفيتهم المطلقة والمطبقة. ولا يعبئون بكل الإصلاحات والتطورات التي حصلت في العصور العباسية والأندلسية وحتى عصر النهضة في القرن التاسع عشر وما تلاه إلى يومنا هذا. كل هذا يعتبر رجسا من عمل الشيطان في نظرهم. وبالتالي فمشروعهم فاشل لأنّه ضدّ الحضارة والتقدّم الإنسانيّ. ويرى مالك شبل إن المتزمتين يتمسكون بالقراءة الحرفية الخاطئة للقرآن الكريم. وهي قراءة ماضوية، لا تاريخية، عفا عليها الزمن. إنها قراءة تجهل المقصد الأسنى للدين ولا تهتمّ إلا بقشوره السطحية. ورؤياهم تبسيطية للأمور أو حتى مانوية ثنوية. فهم يعيدون كل شيء إلى التصنيف الثنائي التالي: مؤمن/ كافر، حلال/ حرام، نجس/ طاهر، الخ..