ولد محمد يعقوبي، الذي عينه الملك محمد السادس، واليا على جهة الرباط -سلا -القنيطرة وعاملا لعمالة الرباط، بتاريخ 30 شتنبر 1969 ببركان، وهو حاصل على دبلوم مهندس دولة في الهندسة المدنية من المدرسة الحسنية للأشغال العمومية. وبدأ محمد يعقوبي مساره المهني بوزارة التجهيز سنة 1992، حيث شغل مهام مدير بمجموعة من الموانىء، كميناء أكادير (1992-1993)، وميناء طانطان سنة 1995، وميناء العيون سنة 1998، وميناء الجرف الأصفر سنة 2001.
كما عين محمد يعقوبي مديرا للمركز الجهوي للاستثمار لجهة دكالة -عبدة ابتداء من فاتح يونيو 2002، ثم لجهة طنجة -تطوان ابتداء من فاتح أبريل 2004. وبتاريخ 22 يونيو 2005، تفضل الملك، وعين السيد محمد يعقوبي عاملا على عمالة المضيقالفنيدق، وهو المنصب الذي ظل يشغله إلى أن عينه جلالته واليا لولاية تطوان وعاملا على إقليمتطوان بتاريخ 26 نونبر 2010.
وعينه الملك واليا على جهة طنجة- تطوان وعاملا على عمالة طنجة- أصيلة بتاريخ 20 يناير 2014، ثم واليا لجهة طنجة-تطوان-الحسيمة وعاملا على عمالة طنجة-أصيلة ابتداء من 13 أكتوبر 2015، بعد دخول التقسيم الإداري الجديد للمملكة حيز التنفيذ.
وارتبط اسمه بحراك الريف حيث كان من بين المحاورين لرفاق الزفزافي عند اندلاع شرارة الحراك بالحسيمة بعد مقتل السماك محسن فكري في اكتوبر 2016 .
وبتاريخ 07 فبراير 2019، جدد الملك محمد السادس ثقته في شخص محمد يعقوبي، فعينه واليا على جهة الرباط -سلا -القنيطرة، وعاملا على عمالة الرباط.