تقام مباريات الدور الثاني بنظام الذهاب والاياب في نونبر المقبل, على ان يتأهل الفائزون الى الدور الثالث الذي سيتم خلاله تقسيم المنتخبات ال20 إلى خمس مجموعات تضم كل منها أربعة منتخبات تتواجه بنظام مباريات الذهاب والاياب. والفائز من كل مجموعة يبلغ مونديال روسيا 2018. البرنامج الكامل النيجر - الكاميرون موريتانيا - تونس نامبيا - غينيا اثيوبيا - الكونغو تشاد - مصر جزر القمر - غانا جيبوتي او سوازيلاند - نيجيريا بوتسوانا - مالي بوروندي - جمهورية الكونغو الديموقراطية ليبيريا - كوت ديفوار مدغشقر - السنغال كينيا - الرأس الاخضر تنزانيا - الجزائر السودان - زامبيا ليبيا - رواندا المغرب - غينيا الاستوائية موزامبيق - الغابون بنين - بوركينا فاسو توغو - اوغندا انغولا - جنوب افريقيا - الدور الثالث (اكتوبر 2016-نونبر 2017)