تخطت سبع فرق لكرة القدم من القسم الثاني الدور الخامس من منافسات كأس العرش لموسم 2012/2013، لكن الدور شهد كذلك العديد من المفاجآت أبرزها خروج مولودية وجدة من المنافسة بعد خسارته أمام النادي القصري، أحد فرق قسم الهواة، وتفوق الاتحاد البيضاوي وأولمبيك مراكش، اللذين نزلا إلى قسم الهواة، موازاة مع تمكن شباب أطلس خنيفرة، الذي ضمن الصعود إلى القسم الثاني، من إقصاء الرشاد البرنوصي الذي لعب نهاية موسم 2006/2007 أمام الجيش الملكي، وأيضا عودة فريق نهضة سطات، الفائز بنسخة 1969 إلى الواجهة. في غضون ذلك رجحت الضربات الترجيحية، كفة اتحاد أيت ملول أمام نهضة الزمامرة، في المباراة التي جرت بملعب الأخير، وانتهى الوقت الأصلي للمباراة لهدف لمثله، في حين انتهت الضربات الترجيحية ب4 مقابل 5. وخسر جمعية سلا بدورة بعد الاحتكام إلى الضربات الترجيحية التي رجحت كفة اتحاد تواركة (القسم الأول هواة) بأربعة أهداف مقابل اثنين أمام جمعية سلا، الذي يلعب الموسم المقبل بالبطولة «الاحترافية». في نفس السياق اجتاز فتح الناظور فريق رجاء بنسودة، وبعد أن انتهت المباراة بالتعادل هدفين لكل فريق، حسم فتح الناظور الذي لعب المباراة على ملعبه بأربعة أهداف مقابل ثلاثة. وأقصي ممثلا فريق المحمدية من المنافسات بعد خسارة شباب المحمدية لمباراته أمام يوسفية برشيد بثلاثة أهداف لصفر، وهزيمة الاتحاد المحلي بهدفين مقابل واحد أمام وفاق بوزنيقة. وتفوق نهضة سطات بثلاثة أهداف مقابل واحد أمام جوهرة كلميم، وبنفس النتيجة فاز اتحاد الخميسات باتحاد وجدة والاتحاد البيضاوي ضد شباب المسيرة. وبدوره تمكن اتحاد طنجة من حجز مقعد له بالدور الموالي بعد فوزه على اتحاد سيدي قاسم بهدفين مقابل واحد، كما أنهى الراسينغ البيضاوي مباراته ضد أولمبيك الدشيرة بثلاثة أهداف مقابل لاشئ، وهي نفس الحصة التي أنهى بها شباب أطلس خنيفرة، الذي يخوض منافسات البطولة الموسم المقبل في القسم الثاني، في حين أن أكبر حصة كانت لصالح الكوكب المراكشي الذي أنهى المباراة ضد الاتحاد الرياضي لولاد بحصة خمسة أهداف مقابل لاشئ.