إزداد محمد اليعقوبي، الذي عينه الملك محمد السادس، الإثنين، بصفة رسمية واليا على جهة طنجةتطوان، في 30 شتنبر 1969 بمدينة بركان. وتولى اليعقوبي بعد حصوله على دبلوم مهندس الدولة في الهندسة المدنية، منصب رئيس مصلحة تهيئة مرافئ ميناء أكادير ابتداء من شتنبر سنة 1992، ثم منصب رئيس إدارة استغلال ميناء أكادير ابتداء من نونبر 1993، ليشغل بعد ذلك منصب مدير استغلال ميناء طانطان ابتداء من شتنبر 1995، ثم منصب مدير استغلال ميناء العيون ابتداء من شتنبر 1998 . وفي نونبر 2001 شغل اليعقوبي منصب مدير استغلال موانئ الجرف الأصفر، قبل أن يعين مديرا للمركز الجهوي للاستثمار لجهة دكالة-عبدة ابتداء من شهر يونيو 2002، وهو المنصب الذي تولاه أيضا بجهة طنجة - تطوان ابتداء من شهر أبريل 2004. وفي يونيو 2005 عين الملك محمد السادس، محمد اليعقوبي عاملا على عمالة المضيق -الفنيدق. قبل أن يتولى اليعقوبي منصب والي لولاية تطوان واعمل إقليمتطوان. وفي ماي 2012، تولى محمد اليعقوبي منصب والي جهة طنجةتطوان، بصفة مؤقتة، مع احتفاظه بمهامه في ولاية وإقليمتطوان، إلى غاية تعيينه بشكل رسمي في كوالي لجهة طنجةتطوان خلفا لمحمد حصاد، الذي يشغل حاليا وزيرا للداخلية. وكان اليعقوبي، قد قدم بين يدي الملك محمد السادس، يوم 26 شتنبر 2013، مشروع "طنجة الكبرى"، وهو البرنامج الضخم الذي تساهم فيه الولاية بنسبة كبيرة في إجراءات تنزيله.