احتلت جامعة سيدي محمد بن عبد الله بفاس في لائحة أحسن جامعات العالم حسب موقع timeshighereducation، الرتبة 801 على الصعيد العالمي مناصفةً مع مجموعة من الجامعات أهمها القاضي عياض بمراكش و محمد الخامس بالرباط، فيما جاءت في الرتبة 80 إفريقياً. جامعة سيدي محمد بن عبد الله هي من بين إحدى أهم جامعات المغرب، إذ لا زالت تحتل الرتبة الأولى وطنياً من حيث عدد المسجلين بها رغم ما تعانيه من مشاكل، هذا وقد سبق أن صنفها موقع infoetell في المرتبة الثالثة وطنيا. أما موقع timeshighereducation الشهير، فيعد أحد أهم المواقع العالمية في مجاله ويعتمد على مجموعة من المعايير لترتيب المئات من الجامعات العالمية حيث يصنف الجامعات اعتماداً على 13 معياراً للجودة.