La Fondation africaine pour l'innovation a mis en place des critères de choix pour être la plus objective possible. Le PIA compte aujourd'hui 3.000 participants en provenance de 49 pays africains, ce qui dénote de la grande importance accordée à cette initiative et le cachet panafricain de ce modèle de compétitivité continentale. Ces critères se déclinent ainsi : Originalité : Innovation, esprit de créativité et d'inventivité ; Qualité marchande : Potentiel pour la commercialisation et la bancarisation ; Développement à plus grande échelle: quelle stratégie pour développer le projet et assurer son extension ? ; Impact social : L'impact socio-économique et les solutions pour relever les défis de développement existants auxquels sont confrontés la communauté, le pays ou le continent dans son ensemble ; Aspects scientifiques/techniques : L'importance technologique ou scientifique de l'innovation dans le domaine concerné et au-delà.
