أطلقت شبكة إسلام أون لاين.نت يوم الأحد 1 مارس 2009 بوابتها المعرفية مدارك للفكر والثقافة الإسلامية المعاصرة، كموقع متخصص في متابعة الحدث والقضية الفكرية بكافة تنويعاته؛ خاصة ما يتعلق بالخطاب الإسلامي. ويسعى الموقع، وفق وثيقته التأسيسية، للمساهمة في بناء خطاب إسلامي منهجي معاصر مشتبك مع الواقع وقضاياه، وتقديم العالم وتعقيداته إلى الفكر والفقه الإسلامي بطريقة مناسبة وعميقة.ويأتي إطلاق الموقع الجديدة كأحد ثمار منظومة التطوير الشاملة للبوابة العربية لشبكة إسلام أون لاين.نت، والتي يتم تدشينها خلال عام ,2009 عبر إطلاق مجموعة من المواقع المتخصصة. وتشمل هذه المجموعة، بالإضافة لموقع مدارك: موقع الإسلاميون، الذي يهتم بشئون الطرق الصوفية والحركات الإسلامية، ويتوقع إطلاقه قريبا، كذلك موقع الأمة اليوم لرصد الشأن الإسلامي وتفاعله مع الأديان الأخرى، وموقع نماء، المختص بمعالجة قضايا تنمية الفرد والمجتمع المحلي والمؤسسة الصغيرة، وموقع صوت وصورة لمواد الفيديو والصوت والصورة. ويتكون موقع مدارك المعرفي من عدة أقسام فرعية، من أبرزها ثقافة وفكر وسياسة ومفاهيم ومصطلحات و تنمية واقتصاد ثم مواقع ومدونات.