Jusqu'à dimanche, les organisateurs avaient recensé 101 cas de Covid-19 liés aux Jeux Paralympiques, dont deux athlètes. Six autres cas ont été signalés par des collectivités locales accueillant des équipes pour des stages d'entraînement. Le Japon est confronté à une vague record d'infections, et la plupart des cas signalés par « Tokyo 2020 » concernent des personnes résidant dans le pays. Selon les organisateurs, 88 % des personnes présentes au village paralympique sont vaccinées.