Cette répartition, publiée le 12 octobre 2011, sur le site internet de la Confédération africaine de football (CAF), tient compte des performances enregistrées durant les trois dernières éditions de la CAN (Egypte-2006, Ghana-2008 et Angola-2010). Ainsi, et conformément aux règlements de la compétition, les deux pays organisateurs de cette édition, la Guinée Equatoriale et le Gabon, seront têtes de série respectivement du groupe A et C, alors que le Ghana et la Côte d'Ivoire qui bénéficient d'un meilleur classement, seront têtes de série des groupes B et D. La première étape sera de fixer les têtes de série des groupes B et D suivant un tirage au sort entre le Ghana et la Côte d'Ivoire qui sont placés dans le Pot 1, avant de procéder à la répartition des douze autres équipes sur les quatre groupes, en commençant par les équipes du Pot 4, puis celles du Pot 3, et ensuite celles du Pot 2. Rappelons que 16 pays prendront part à la phase finale de la CAN-2012, prévue du 21 janvier au 12 février 2012, et seront répartis dans quatre groupes. A l'issue du premier tour, les deux premiers de chaque groupe se qualifieront pour les quarts de finale.
