Le phoque moine figure depuis 1966 sur la “liste rouge” des espèces menacées de l'Union internationale de la conservation de la nature (UICN). Selon des données publiées par le Haut Commissariat aux eaux et forêts dans le cadre d'une étude nationale sur les aires protégées, l'animal était autrefois présent dans tout le bassin méditerranéen. Sa population mondiale est aujourd'hui estimée entre 300 et 500 individus dont l'aire de répartition s'est extrêmement réduite au fil des années. En Méditerranée, de très petites populations fragmentaires de quelques individus survivent sur une portion de la Sardaigne (Italie), dans l'Adriatique, sur les côtes de Lybie, Tunisie, Algérie et sur la côte méditerranéenne du Maroc.
