La chaire se donne pour objectifs concrets la mise en place de groupes de réflexion et ateliers d'écriture pluridisciplinaires, l'octroi de bourses doctorales et postdoctorales et la publication d'ouvrages sur des thèmes novateurs suscitant le débat public, explique un communiqué conjoint des initiateurs. Tenant compte d'un devoir de loyauté éthique à la démarche et aux thèmes de prédilection de Fatima Mernissi, la chaire se fixe comme principes, le décloisonnement des disciplines l'ouverture sociétale et l'interaction avec le monde. Elle s'engage également à respecter l'équilibre que Fatima Mernissi a toujours voulu maintenir entre liberté, indépendance et pudeur, et à rendre compte de son aura internationale en veillant surtout à prolonger par la critique, la réflexion et le travail de terrain, son legs, souligne le communiqué. Pour veiller à la cohérence et l'efficience de la chaire, les deux institutions en confient la coordination conjointe au sociologue Mokhtar El Harras, professeur à la Faculté des lettres et sciences humaines, et l'écrivain Driss Ksikes, directeur du Cesem.
