جاءت الهيكلة الجديدة لوزارة الأوقاف والشؤون الإسلامية بإحداث عدة مديريات على الصعيد المركزي منها مديرية للتعليم العتيق، وتبين المادة الرابعة عشرة والخامسة عشرة اختصاصات هذه المديرية ومرافقها الهيكلية، وقد تم نشرها بالجريدة الرسمية عدد: 5172 بتاريخ فاتح ذي القعدة 1424(25 دجنبر2003)، وفي ما يلي توضيح لهذه الاختصاصات والهيكلة: تختص مديرية التعليم العتيق حسب المادة 14 بما يلي: تحديد الاستراتيجية التربوية المتعلقة بالتعليم العتيق؛ إعداد الخريطة الوطنية لمؤسسات التعليم العتيق؛ وضع نظم الدراسات والامتحانات؛ منح رخص فتح مؤسسات التعليم العتيق والسهر على تطبيق النصوص التشريعية والتنظيمية المتعلقة بها، ولا سيما فيما يخص مراقبة مدى احترامها لالتزاماتها التربوية والإدارية؛ دراسة طلبات واقتراحات ضم مؤسسات التعليم العتيق الخاصة؛ اقتراح الإجراءات الكفيلة بدعم مؤسسات التعليم العتيق ومساعدتها على أداء مهامها في أحسن الظروف؛ مراقبة تنفيذ البرامج والمناهج وتقويمها؛ السهر على التكوين الأساسي والتكوين المستمر لأطر التعليم العتيق مخلق الفضاءات التربوية والأنشطة الموازية لتلاميذ وطلبة التعليم العتيق؛ التنسيق والاتصال مع الجهات المهتمة بقضايا التربية والتكوين. أما هيكلتها فتوضحها المادة ,15 التي تشير أن مديرية التعليم العتيق تشتمل على ما يلي: قسم التخطيط والتكوين ويتألف من: مصلحة التخطيط والتوجيه التربوي؛ مصلحة التكوين مصلحة الترخيصات. قسم برامج ومناهج التعليم العتيق الذي يتألف من: مصلحة البرامج والمناهج والكتاب المدرسي؛ مصلحة التفتيش والمراقبة؛ مصلحة الامتحانات؛ مصلحة الدعم البيداغوجي. قسم تسيير مؤسسات التعليم العتيق الذي يتألف من: مصلحة التعليم الأولي والابتدائي؛ مصلحة التعليم الإعدادي والثانوي؛ مصلحة التعليم النهائي؛ مصلحة الأنشطة الثقافية والاجتماعية.