توصلت السلطات المصرية إلى اسم خاطف الطائرة، والذي أجبر قائدها لتغيير وجهتها من مطار القاهرة طائرة، والذي أجبر قائدها لتغيير وجهتها من مطار القاهرة إلى قبرص، ويُدعى سيف الدين مصطفى محمد إمام. وولد المتهم في 23 يونيو 1957، ويسكن في مدينة حلوان بمحافظة القاهرة، وهو مسجل خطر جنائي في 16 قضية متنوعة منها تزوير وسرقات مساكن وانتحال صفة ومخدرات وإصدار شيكات بدون رصيد، وكان أخرها عام 2007. وفصل سيف الدين من كلية الحقوق جامعة بيروت بالإسكندرية، وأسس شركة وهمية ليخفى خلفها كل جرائمه، حملت اسم "سيف الدين لتوريدات السلع الغذائية"، وفق مصادر صحفية مصرية. وسبق وتم اعتقاله 3 مرات وصدر حكم بحبسه عام 2010، إلا أنه استطاع الهرب خلال أحداث 25 يناير 2011، ثم سلم نفسه عام 2014 وقضى فترة العقوبة وتم الافراج عنه عام 2015. وكان سيف الدين مصطفى قد اختطف طائرة مصر للطيران من مطار برج العرب بعد فقدان الاتصال بها وتوجه بها إلى قبرص حيث هبطت الطائرة في مطار لارنكا، مهددا طاقم الطائرة بحزام ناسف كان يرتديه أسفل ملابسه لإجبارهم على تغيير مسار الطائرة. والطائرة تحمل رقم رحلة 181 طيران داخلي، وتقل على متنها 55 راكبا، وتم فقدان الاتصال بها بعد فترة وجيزة من إقلاعها في طريقها لمطار القاهرة.