بلغت نسبة المسجلين الجدد بجامعة مولاي اسماعيل بمكناس برسم موسم 2011-2012 ارتفاعا ملحوظا، حيث وصل إلى 25 في المائة مقارنة مع الموسم الماضي، وبلغ عددهم 33 ألفا و969 طالبا دون احتساب عدد الطلبة في سلك الماستر المهنية. وشهد عدد الطلبة الجدد ارتفاعا بنسبة 54 في المائة مقارنة مع العدد المتوقع في عقد تطوير الجامعة ضمن المخطط الاستعجالي، حسب ما أدلى به رئيس الجامعة للصحافة. ويتوزع الطلبة على الكليات التابعة للجامعة، كلية الآداب والعلوم الإنسانية وكلية العلوم وكلية الحقوق والعلوم القانونية والاقتصادية والاجتماعية والكلية متعددة التخصصات إلى جانب المدارس العليا كالمدرسة الوطنية العليا للفنون والمهن، والمدرسة العليا للتكنولوجيا، والمدرسة العليا للأساتذة بنسب متفاوتة.