من الأسباب الأخرى لانتفاخ البطن حدوث خلل في توازن الميكروبات داخل الأمعاء بعد تناول علاج بالمضادات الحيوية، والعلاج لمثل هذه الحالات هو تناول البروبيوتيك وهي خمائر حميدة توجد في بعض أنواع الياغورت أو على شكل مكملات تعيد التوازن إلى المعدة بتناولها لمدة أسبوع. يضاف مشكل عدم تحمل هضم لاكتوز ، وهو السكر الموجود في الحليب ومشتقاته عن بعض الناس، الذي يؤدي إلى تفاقم مشكل انتفاخ البطن، وهذا الأمر لا يعني الامتناع كليا عن تناول الحليب ومشتقاته نظرا لاحتوائه على عناصر مفيدة أهمها الكالسيوم والبروتين، فبإمكان هؤلاء الأشخاص تحمل قدر قليل من الحليب يعادل كوبا صغيرا دون أن يسبب لهم هذا الأمر انتفاخا للبطن، هؤلاء الأشخاص بإمكانهم أن يقوموا بتجزيء لكمية الحليب التي يمكن أن يتناولوها على مدار اليوم للتخفيف من أعراض الانتفاخ، كما يمكنهم اللجوء إلى أنواع الحليب الخالية من لاكتوز. نفس المشكل بالنسبة لمن يعانون من عدم قدرة أمعائهم على هضم الفريكتوز الموجود في الفواكه والمشروبات، ولتفادي انتفاخ البطن عند هؤلاء الأشخاص يستحسن تجنب المشروبات المركزة بالفريكتوز كالعصائر، أو القيام بتخفيفها بالماء، والأفضل هو تناول القليل من الفاكهة على فترات متقطعة، لأن كمية الفريكتوز الموجود في العصير هو ضعف ما يوجد في عصير الفاكهة.